L’ENSV-FVI est partenaire d’institutions, associations et organisations professionnelles françaises porteuses d’une valence vétérinaire :
AEEMA (Association pour l’étude de l’épidémiologie des maladies animales), OFB (Office français de la biodiversité), ainsi que du corps des vétérinaires du Service de Santé des Armées françaises.
FVI est aussi membre fondateur d’une Alliance qui regroupe sept « opérateurs métiers » (dont Expertise France, JCI, Civipol…) de l’expertise publique française ayant signé une charte de bonne conduite et de compétitivité.